أقسام الطوارئ للأطفال والكبار
يحتوي المستشفى السلطاني على قسمين مختلفين لطوارئ الأطفال والكبار اضافة الى صالة الولادة المختصه بأمراض الحمل والولادة. يتم تحويل حالات الحوادث بعد استقرار الحالة الصحية إلى مستشفى خولة الذي يعتبر المركز المختص لحالات الحوادث. لقد تم تجهيزغرف الإنعاش في أقسام الطوارئ بكل ماتحتاج اليه الحالات الواردة اليها وهي قادرة على استيعاب عدة مرضى في آن واحد.
تحتوي أقسام الطوارئ على 14 غرفة للمعاينة و للعلاج في طوارئ الكبار و4 بطوارئ الأطفال. كما تحتوي هذه الأقسام على اسرة للمراقبة والملاحظة لمده لا تزيد عن 6 ساعات للنظر فيما كان حلة المرضى تستدعي الترقيد أم بإمكان المريض الذهاب الى البيت.
العيادات المتخصصة
تقدم العيادات الخارجية بالمستشفى السلطاني الخدمات الصحية للمرضى المحولين من غير حالات الطوارئ. إن طلبات التحويل الواردة من المؤسسات الصحية الأخرى يتم معاينتها و تصنيفها من حيث مناسبتها و مدى أولويتها و ذلك من قبل الأطباء الاختصاصيين في التخصصات الطبية المختلفة ومن ثم يتم جدولة موعد لكل منها تبعا لذلك. يتم استقبال قرابة 500 حالة محوله يوميا في العيادات الخارجية إما كزيارة أولى أو زيارات مراجعة بغرض التشخيص أو المتابعة. هناك اهتمام بالغ بإعادة تحويل هؤلاء المرضى إلى مستشفيات مناطقهم ليتم متابعهم بعد استيفاء الهدف من تحويلهم إلى المستشفى السلطاني.
فترات الانتظار للمواعيد يتم مراقبتها لضمان عدم اضطرارا المرضى للانتظارطويلا لمواعيدهم و ذلك أخذاً في الاعتبار أن التحويل يتم للحالات التي تحتاج رعاية صحية ثالثية المستوى و إلى رأي الأطباء المتخصصين. حيث يوجد في الأسبوع الواحد أربعين عيادة متخصصة لأمراض الكبار والأطفال والنساء والولادة.
غرف طوارئ الولادة
يوفر المستشفى العناية الطبية لحالات الولادة والحالات الطارئة للحمل بعد الأسبوع الثامن والعشرين من الحمل في قسم خاص بها. ويوجد مدخل هذ القسم "صالة الولادة" بالطابق الأرضي للمستشفى . وتضم صالة الولاده 4 اسرة لمعاينه و 13 غرفة خاصة للولادة و4 أسره للعناية الحرجة. كما أن القسم مزود بغرف خاصة للعمليات الخاصة بطوارئ الحمل والولادة. 
العناية اليومية
من خلال وحدات الرعاية اليومية يتم القيام بالكثير من الإجراءات العلاجية والتشخيصية. من أمثلة ذلك: العلاج الكيميائي لمرضى السرطان، و تفتيت الحصى، وغسيل الكلى، وعمليات المنظار للمعده والمرئ، وعمليات المنظار للرئة والمجرى التنفسي، وعمليات القصطرة للأوعية الدموية والشرايين، وأخذ عينات النخاع العظمي، والعلاج لبعض أمراض الدم، و نقل الدم وغيرها. ويتم حاليا انشاء جناح مختص للعناية اليومية.
